Polygenic prediction of educational attainment within and between families from genome-wide association analyses in 3 million individuals
Articolo
Data di Pubblicazione:
2022
Citazione:
Polygenic prediction of educational attainment within and between families from genome-wide association analyses in 3 million individuals / Okbay, A.; Wu, Y.; Wang, N.; Jayashankar, H.; Bennett, M.; Nehzati, S. M.; Sidorenko, J.; Kweon, H.; Goldman, G.; Gjorgjieva, T.; Jiang, Y.; Hicks, B.; Tian, C.; Hinds, D. A.; Ahlskog, R.; Magnusson, P. K. E.; Oskarsson, S.; Hayward, C.; Campbell, A.; Porteous, D. J.; Freese, J.; Herd, P.; Agee, M.; Alipanahi, B.; Auton, A.; Bell, R. K.; Bryc, K.; Elson, S. L.; Fontanillas, P.; Furlotte, N. A.; Hinds, D. A.; Huber, K. E.; Kleinman, A.; Litterman, N. K.; Mccreight, J. C.; Mcintyre, M. H.; Mountain, J. L.; Northover, C. A. M.; Pitts, S. J.; Sathirapongsasuti, J. F.; Sazonova, O. V.; Shelton, J. F.; Shringarpure, S.; Tung, J. Y.; Vacic, V.; Wilson, C. H.; Fontana, M. A.; Pers, T. H.; Rietveld, C. A.; Chen, G. -B.; Emilsson, V.; Meddens, S. F. W.; Pickrell, J. K.; Thom, K.; Timshel, P.; de Vlaming, R.; Abdellaoui, A.; Ahluwalia, T. S.; Bacelis, J.; Baumbach, C.; Bjornsdottir, G.; Brandsma, J. H.; Concas, M. P.; Derringer, J.; Galesloot, T. E.; Girotto, G.; Gupta, R.; Hall, L. M.; Harris, S. E.; Hofer, E.; Horikoshi, M.; Huffman, J. E.; Kaasik, K.; Kalafati, I. P.; Karlsson, R.; Lahti, J.; van der Lee, S. J.; de Leeuw, C.; Lind, P. A.; Lindgren, K. -O.; Liu, T.; Mangino, M.; Marten, J.; Mihailov, E.; Miller, M. B.; van der Most, P. J.; Oldmeadow, C.; Payton, A.; Pervjakova, N.; Peyrot, W. J.; Qian, Y.; Raitakari, O.; Rueedi, R.; Salvi, E.; Schmidt, B.; Schraut, K. E.; Shi, J.; Smith, A. V.; Poot, R. A.; Pourcain, B. S.; Teumer, A.; Thorleifsson, G.; Verweij, N.; Vuckovic, D.; Wellmann, J.; Westra, H. -J.; Yang, J.; Zhao, W.; Zhu, Z.; Alizadeh, B. Z.; Amin, N.; Bakshi, A.; Baumeister, S. E.; Biino, G.; Bonnelykke, K.; Boyle, P. A.; Campbell, H.; Cappuccio, F. P.; Davies, G.; De Neve, J. -E.; Deloukas, P.; Demuth, I.; Ding, J.; Eibich, P.; Eisele, L.; Eklund, N.; Evans, D. M.; Faul, J. D.; Feitosa, M. F.; Forstner, A. J.; Gandin, I.; Gunnarsson, B.; Halldorsson, B. V.; Harris, T. B.; Heath, A. C.; Hocking, L. J.; Holliday, E. G.; Homuth, G.; Horan, M. A.; Hottenga, J. -J.; de Jager, P. L.; Joshi, P. K.; Jugessur, A.; Kaakinen, M. A.; Kahonen, M.; Kanoni, S.; Keltigangas-Jarvinen, L.; Kiemeney, L. A. L. M.; Kolcic, I.; Koskinen, S.; Kraja, A. T.; Kroh, M.; Kutalik, Z.; Latvala, A.; Launer, L. J.; Lebreton, M. P.; Levinson, D. F.; Lichtenstein, P.; Lichtner, P.; Liewald, D. C. M.; Loukola, A.; Madden, P. A.; Magi, R.; Maki-Opas, T.; Marioni, R. E.; Marques-Vidal, P.; Meddens, G. A.; Mcmahon, G.; Meisinger, C.; Meitinger, T.; Milaneschi, Y.; Milani, L.; Montgomery, G. W.; Myhre, R.; Nelson, C. P.; Nyholt, D. R.; Ollier, W. E. R.; Palotie, A.; Paternoster, L.; Pedersen, N. L.; Petrovic, K. E.; Raikkonen, K.; Ring, S. M.; Robino, A.; Rostapshova, O.; Rudan, I.; Rustichini, A.; Salomaa, V.; Sanders, A. R.; Sarin, A. -P.; Schmidt, H.; Scott, R. J.; Smith, B. H.; Smith, J. A.; Staessen, J. A.; Steinhagen-Thiessen, E.; Strauch, K.; Terracciano, A.; Tobin, M. D.; Ulivi, S.; Vaccargiu, S.; Quaye, L.; van Rooij, F. J. A.; Venturini, C.; Vinkhuyzen, A. A. E.; Volker, U.; Volzke, H.; Vonk, J. M.; Vozzi, D.; Waage, J.; Ware, E. B.; Willemsen, G.; Attia, J. R.; Bennett, D. A.; Berger, K.; Bertram, L.; Bisgaard, H.; Boomsma, D. I.; Borecki, I. B.; Bultmann, U.; Chabris, C. F.; Cucca, F.; Cusi, D.; Deary, I. J.; Dedoussis, G. V.; van Duijn, C. M.; Eriksson, J. G.; Franke, B.; Franke, L.; Gasparini, P.; Gejman, P. V.; Gieger, C.; Grabe, H. -J.; Gratten, J.; Groenen, P. J. F.; Gudnason, V.; van der Harst, P.; Hoffmann, W.; Hypponen, E.; Iacono, W. G.; Jacobsson, B.; Jarvelin, M. -R.; Jockel, K. -H.; Kaprio, J.; Kardia, S. L. R.; Lehtimaki, T.; Lehrer, S. F.; Martin, N. G.; Mcgue, M.; Metspalu, A.; Pendleton, N.; Penninx, B. W. J. H.; Perola, M.; Pirastu, N.; Pirastu, M.; Polasek, O.; Posthuma, D.; Power, C.; Province, M. A.; Samani, N. J.; Schlessinger, D.; Schmidt, R.; Sorensen, T. I. A.; Spector, T. D.; Stefansson
Abstract:
We conduct a genome-wide association study (GWAS) of educational attainment (EA) in a sample of ~3 million individuals and identify 3,952 approximately uncorrelated genome-wide-significant single-nucleotide polymorphisms (SNPs). A genome-wide polygenic predictor, or polygenic index (PGI), explains 12–16% of EA variance and contributes to risk prediction for ten diseases. Direct effects (i.e., controlling for parental PGIs) explain roughly half the PGI’s magnitude of association with EA and other phenotypes. The correlation between mate-pair PGIs is far too large to be consistent with phenotypic assortment alone, implying additional assortment on PGI-associated factors. In an additional GWAS of dominance deviations from the additive model, we identify no genome-wide-significant SNPs, and a separate X-chromosome additive GWAS identifies 57.
Tipologia CRIS:
1.1 Articolo in rivista
Elenco autori:
Okbay, A.; Wu, Y.; Wang, N.; Jayashankar, H.; Bennett, M.; Nehzati, S. M.; Sidorenko, J.; Kweon, H.; Goldman, G.; Gjorgjieva, T.; Jiang, Y.; Hicks, B.; Tian, C.; Hinds, D. A.; Ahlskog, R.; Magnusson, P. K. E.; Oskarsson, S.; Hayward, C.; Campbell, A.; Porteous, D. J.; Freese, J.; Herd, P.; Agee, M.; Alipanahi, B.; Auton, A.; Bell, R. K.; Bryc, K.; Elson, S. L.; Fontanillas, P.; Furlotte, N. A.; Hinds, D. A.; Huber, K. E.; Kleinman, A.; Litterman, N. K.; Mccreight, J. C.; Mcintyre, M. H.; Mountain, J. L.; Northover, C. A. M.; Pitts, S. J.; Sathirapongsasuti, J. F.; Sazonova, O. V.; Shelton, J. F.; Shringarpure, S.; Tung, J. Y.; Vacic, V.; Wilson, C. H.; Fontana, M. A.; Pers, T. H.; Rietveld, C. A.; Chen, G. -B.; Emilsson, V.; Meddens, S. F. W.; Pickrell, J. K.; Thom, K.; Timshel, P.; de Vlaming, R.; Abdellaoui, A.; Ahluwalia, T. S.; Bacelis, J.; Baumbach, C.; Bjornsdottir, G.; Brandsma, J. H.; Concas, M. P.; Derringer, J.; Galesloot, T. E.; Girotto, G.; Gupta, R.; Hall, L. M.; Harris, S. E.; Hofer, E.; Horikoshi, M.; Huffman, J. E.; Kaasik, K.; Kalafati, I. P.; Karlsson, R.; Lahti, J.; van der Lee, S. J.; de Leeuw, C.; Lind, P. A.; Lindgren, K. -O.; Liu, T.; Mangino, M.; Marten, J.; Mihailov, E.; Miller, M. B.; van der Most, P. J.; Oldmeadow, C.; Payton, A.; Pervjakova, N.; Peyrot, W. J.; Qian, Y.; Raitakari, O.; Rueedi, R.; Salvi, E.; Schmidt, B.; Schraut, K. E.; Shi, J.; Smith, A. V.; Poot, R. A.; Pourcain, B. S.; Teumer, A.; Thorleifsson, G.; Verweij, N.; Vuckovic, D.; Wellmann, J.; Westra, H. -J.; Yang, J.; Zhao, W.; Zhu, Z.; Alizadeh, B. Z.; Amin, N.; Bakshi, A.; Baumeister, S. E.; Biino, G.; Bonnelykke, K.; Boyle, P. A.; Campbell, H.; Cappuccio, F. P.; Davies, G.; De Neve, J. -E.; Deloukas, P.; Demuth, I.; Ding, J.; Eibich, P.; Eisele, L.; Eklund, N.; Evans, D. M.; Faul, J. D.; Feitosa, M. F.; Forstner, A. J.; Gandin, I.; Gunnarsson, B.; Halldorsson, B. V.; Harris, T. B.; Heath, A. C.; Hocking, L. J.; Holliday, E. G.; Homuth, G.; Horan, M. A.; Hottenga, J. -J.; de Jager, P. L.; Joshi, P. K.; Jugessur, A.; Kaakinen, M. A.; Kahonen, M.; Kanoni, S.; Keltigangas-Jarvinen, L.; Kiemeney, L. A. L. M.; Kolcic, I.; Koskinen, S.; Kraja, A. T.; Kroh, M.; Kutalik, Z.; Latvala, A.; Launer, L. J.; Lebreton, M. P.; Levinson, D. F.; Lichtenstein, P.; Lichtner, P.; Liewald, D. C. M.; Loukola, A.; Madden, P. A.; Magi, R.; Maki-Opas, T.; Marioni, R. E.; Marques-Vidal, P.; Meddens, G. A.; Mcmahon, G.; Meisinger, C.; Meitinger, T.; Milaneschi, Y.; Milani, L.; Montgomery, G. W.; Myhre, R.; Nelson, C. P.; Nyholt, D. R.; Ollier, W. E. R.; Palotie, A.; Paternoster, L.; Pedersen, N. L.; Petrovic, K. E.; Raikkonen, K.; Ring, S. M.; Robino, A.; Rostapshova, O.; Rudan, I.; Rustichini, A.; Salomaa, V.; Sanders, A. R.; Sarin, A. -P.; Schmidt, H.; Scott, R. J.; Smith, B. H.; Smith, J. A.; Staessen, J. A.; Steinhagen-Thiessen, E.; Strauch, K.; Terracciano, A.; Tobin, M. D.; Ulivi, S.; Vaccargiu, S.; Quaye, L.; van Rooij, F. J. A.; Venturini, C.; Vinkhuyzen, A. A. E.; Volker, U.; Volzke, H.; Vonk, J. M.; Vozzi, D.; Waage, J.; Ware, E. B.; Willemsen, G.; Attia, J. R.; Bennett, D. A.; Berger, K.; Bertram, L.; Bisgaard, H.; Boomsma, D. I.; Borecki, I. B.; Bultmann, U.; Chabris, C. F.; Cucca, F.; Cusi, D.; Deary, I. J.; Dedoussis, G. V.; van Duijn, C. M.; Eriksson, J. G.; Franke, B.; Franke, L.; Gasparini, P.; Gejman, P. V.; Gieger, C.; Grabe, H. -J.; Gratten, J.; Groenen, P. J. F.; Gudnason, V.; van der Harst, P.; Hoffmann, W.; Hypponen, E.; Iacono, W. G.; Jacobsson, B.; Jarvelin, M. -R.; Jockel, K. -H.; Kaprio, J.; Kardia, S. L. R.; Lehtimaki, T.; Lehrer, S. F.; Martin, N. G.; Mcgue, M.; Metspalu, A.; Pendleton, N.; Penninx, B. W. J. H.; Perola, M.; Pirastu, N.; Pirastu, M.; Polasek, O.; Posthuma, D.; Power, C.; Province, M. A.; Samani, N. J.; Schlessinger, D.; Schmidt, R.; Sorensen, T. I. A.; Spector, T. D.; Stefansson, K.; Thorsteinsdottir, U.; Thurik, A. R.; Timpson, N. J.; Tiemeier, H.; Uitterlinden, A. G.; Vitart, V.; Vollenweider, P.; Weir, D. R.; Wil
Link alla scheda completa:
Pubblicato in: